Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rad50P70388 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rad50P70388 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rad50P70388 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Rad50P70388 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rad50P70388 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rad50P70388 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rad50P70388 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rad50P70388 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rad50P70388 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rad50P70388 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rad50P70388 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rad50P70388 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Rad50P70388 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rad50P70388 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rad50P70388 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rad50P70388 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rad50P70388 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rad50P70388 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rad50P70388 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rad50P70388 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rad50P70388 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rad50P70388 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rad50P70388 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rad50P70388 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rad50P70388 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rad50P70388 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rad50P70388 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rad50P70388 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rad50P70388 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rad50P70388 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rad50P70388 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rad50P70388 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rad50P70388 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rad50P70388 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rad50P70388 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rad50P70388 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rad50P70388 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rad50P70388 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rad50P70388 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rad50P70388 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rad50P70388 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rad50P70388 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rad50P70388 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rad50P70388 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rad50P70388 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rad50P70388 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rad50P70388 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rad50P70388 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rad50P70388 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rad50P70388 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rad50P70388 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rad50P70388 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rad50P70388 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rad50P70388 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rad50P70388 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rad50P70388 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rad50P70388 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rad50P70388 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rad50P70388 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rad50P70388 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rad50P70388 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rad50P70388 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rad50P70388 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rad50P70388 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rad50P70388 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rad50P70388 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rad50P70388 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rad50P70388 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rad50P70388 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rad50P70388 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rad50P70388 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rad50P70388 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rad50P70388 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rad50P70388 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rad50P70388 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rad50P70388 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rad50P70388 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rad50P70388 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rad50P70388 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rad50P70388 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rad50P70388 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rad50P70388 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rad50P70388 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rad50P70388 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rad50P70388 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rad50P70388 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rad50P70388 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rad50P70388 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rad50P70388 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rad50P70388 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rad50P70388 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rad50P70388 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Rad50P70388 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rad50P70388 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rad50P70388 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rad50P70388 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rad50P70388 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rad50P70388 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rad50P70388 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms