Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrig1P70193 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrig1P70193 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrig1P70193 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrig1P70193 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrig1P70193 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrig1P70193 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrig1P70193 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrig1P70193 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrig1P70193 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrig1P70193 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrig1P70193 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrig1P70193 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrig1P70193 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrig1P70193 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrig1P70193 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrig1P70193 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrig1P70193 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrig1P70193 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrig1P70193 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrig1P70193 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrig1P70193 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrig1P70193 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrig1P70193 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrig1P70193 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrig1P70193 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrig1P70193 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrig1P70193 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrig1P70193 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrig1P70193 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrig1P70193 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrig1P70193 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrig1P70193 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrig1P70193 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrig1P70193 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrig1P70193 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrig1P70193 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrig1P70193 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrig1P70193 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrig1P70193 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrig1P70193 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrig1P70193 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrig1P70193 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrig1P70193 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrig1P70193 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrig1P70193 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrig1P70193 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrig1P70193 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrig1P70193 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrig1P70193 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrig1P70193 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrig1P70193 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrig1P70193 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrig1P70193 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrig1P70193 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrig1P70193 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrig1P70193 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrig1P70193 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrig1P70193 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrig1P70193 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrig1P70193 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrig1P70193 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrig1P70193 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrig1P70193 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrig1P70193 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrig1P70193 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrig1P70193 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrig1P70193 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrig1P70193 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrig1P70193 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrig1P70193 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrig1P70193 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrig1P70193 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrig1P70193 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrig1P70193 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrig1P70193 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrig1P70193 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrig1P70193 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrig1P70193 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrig1P70193 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrig1P70193 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrig1P70193 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrig1P70193 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrig1P70193 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrig1P70193 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Lrig1P70193 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Lrig1P70193 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrig1P70193 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrig1P70193 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrig1P70193 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrig1P70193 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrig1P70193 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrig1P70193 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrig1P70193 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrig1P70193 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrig1P70193 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrig1P70193 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrig1P70193 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrig1P70193 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrig1P70193 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms