Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Acta1P68134 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Acta1P68134 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Acta1P68134 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Acta1P68134 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Acta1P68134 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Acta1P68134 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Acta1P68134 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Acta1P68134 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Acta1P68134 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Acta1P68134 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Acta1P68134 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Acta1P68134 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Acta1P68134 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Acta1P68134 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Acta1P68134 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Acta1P68134 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Acta1P68134 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Acta1P68134 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Acta1P68134 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Acta1P68134 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Acta1P68134 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Acta1P68134 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Acta1P68134 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Acta1P68134 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Acta1P68134 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Acta1P68134 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Acta1P68134 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Acta1P68134 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Acta1P68134 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Acta1P68134 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Acta1P68134 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Acta1P68134 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Acta1P68134 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Acta1P68134 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Acta1P68134 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Acta1P68134 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Acta1P68134 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Acta1P68134 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Acta1P68134 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Acta1P68134 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Acta1P68134 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Acta1P68134 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acta1P68134 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acta1P68134 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acta1P68134 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acta1P68134 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acta1P68134 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acta1P68134 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acta1P68134 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acta1P68134 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acta1P68134 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acta1P68134 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acta1P68134 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acta1P68134 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acta1P68134 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acta1P68134 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acta1P68134 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acta1P68134 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acta1P68134 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Acta1P68134 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Acta1P68134 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Acta1P68134 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Acta1P68134 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Acta1P68134 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Acta1P68134 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Acta1P68134 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Acta1P68134 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Acta1P68134 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acta1P68134 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acta1P68134 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acta1P68134 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acta1P68134 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acta1P68134 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acta1P68134 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acta1P68134 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acta1P68134 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acta1P68134 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acta1P68134 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acta1P68134 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Acta1P68134 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Acta1P68134 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Acta1P68134 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Acta1P68134 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Acta1P68134 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Acta1P68134 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Acta1P68134 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Acta1P68134 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acta1P68134 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acta1P68134 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acta1P68134 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acta1P68134 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acta1P68134 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acta1P68134 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acta1P68134 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acta1P68134 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acta1P68134 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acta1P68134 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Acta1P68134 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Acta1P68134 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms