Protein–RNA interactions for Protein: P68033

Actc1, Actin, alpha cardiac muscle 1, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actc1P68033 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Actc1P68033 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Actc1P68033 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Actc1P68033 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Actc1P68033 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Actc1P68033 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Actc1P68033 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Actc1P68033 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Actc1P68033 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Actc1P68033 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Actc1P68033 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Actc1P68033 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Actc1P68033 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Actc1P68033 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Actc1P68033 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Actc1P68033 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Actc1P68033 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Actc1P68033 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Actc1P68033 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Actc1P68033 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Actc1P68033 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Actc1P68033 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Actc1P68033 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Actc1P68033 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Actc1P68033 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Actc1P68033 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Actc1P68033 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Actc1P68033 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Actc1P68033 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Actc1P68033 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Actc1P68033 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Actc1P68033 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Actc1P68033 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Actc1P68033 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Actc1P68033 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Actc1P68033 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Actc1P68033 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Actc1P68033 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Actc1P68033 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Actc1P68033 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Actc1P68033 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Actc1P68033 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Actc1P68033 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Actc1P68033 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Actc1P68033 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Actc1P68033 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Actc1P68033 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Actc1P68033 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Actc1P68033 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Actc1P68033 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Actc1P68033 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Actc1P68033 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Actc1P68033 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Actc1P68033 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Actc1P68033 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Actc1P68033 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Actc1P68033 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Actc1P68033 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Actc1P68033 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Actc1P68033 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Actc1P68033 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Actc1P68033 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Actc1P68033 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Actc1P68033 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Actc1P68033 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Actc1P68033 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Actc1P68033 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Actc1P68033 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Actc1P68033 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Actc1P68033 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Actc1P68033 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Actc1P68033 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Actc1P68033 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Actc1P68033 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Actc1P68033 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Actc1P68033 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Actc1P68033 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Actc1P68033 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Actc1P68033 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Actc1P68033 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Actc1P68033 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Actc1P68033 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Actc1P68033 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Actc1P68033 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Actc1P68033 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Actc1P68033 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Actc1P68033 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Actc1P68033 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Actc1P68033 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Actc1P68033 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Actc1P68033 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Actc1P68033 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Actc1P68033 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Actc1P68033 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Actc1P68033 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Actc1P68033 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Actc1P68033 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Actc1P68033 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Actc1P68033 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Actc1P68033 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms