Protein–RNA interactions for Protein: P63044

Vamp2, Vesicle-associated membrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp2P63044 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms