Protein–RNA interactions for Protein: P62889

Rpl30, 60S ribosomal protein L30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl30P62889 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl30P62889 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl30P62889 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl30P62889 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl30P62889 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl30P62889 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl30P62889 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl30P62889 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl30P62889 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl30P62889 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl30P62889 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl30P62889 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl30P62889 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl30P62889 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl30P62889 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl30P62889 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl30P62889 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl30P62889 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl30P62889 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl30P62889 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl30P62889 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl30P62889 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl30P62889 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl30P62889 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl30P62889 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl30P62889 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl30P62889 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl30P62889 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl30P62889 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl30P62889 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl30P62889 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl30P62889 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl30P62889 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl30P62889 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl30P62889 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl30P62889 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl30P62889 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl30P62889 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl30P62889 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl30P62889 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl30P62889 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl30P62889 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl30P62889 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl30P62889 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl30P62889 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl30P62889 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl30P62889 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl30P62889 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl30P62889 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl30P62889 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl30P62889 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl30P62889 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl30P62889 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl30P62889 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl30P62889 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl30P62889 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl30P62889 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl30P62889 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl30P62889 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl30P62889 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl30P62889 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl30P62889 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl30P62889 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl30P62889 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl30P62889 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl30P62889 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpl30P62889 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpl30P62889 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpl30P62889 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpl30P62889 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpl30P62889 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl30P62889 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl30P62889 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl30P62889 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl30P62889 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl30P62889 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl30P62889 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl30P62889 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl30P62889 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl30P62889 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl30P62889 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl30P62889 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl30P62889 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl30P62889 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl30P62889 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl30P62889 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl30P62889 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl30P62889 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl30P62889 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl30P62889 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl30P62889 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl30P62889 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl30P62889 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl30P62889 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl30P62889 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl30P62889 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl30P62889 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl30P62889 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl30P62889 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl30P62889 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms