Protein–RNA interactions for Protein: P62874

Gnb1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnb1P62874 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms