Protein–RNA interactions for Protein: P62737

Acta2, Actin, aortic smooth muscle, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta2P62737 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acta2P62737 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acta2P62737 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acta2P62737 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acta2P62737 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Acta2P62737 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Acta2P62737 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Acta2P62737 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Acta2P62737 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Acta2P62737 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Acta2P62737 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Acta2P62737 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Acta2P62737 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Acta2P62737 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Acta2P62737 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Acta2P62737 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Acta2P62737 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Acta2P62737 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Acta2P62737 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acta2P62737 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acta2P62737 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acta2P62737 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acta2P62737 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acta2P62737 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acta2P62737 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acta2P62737 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acta2P62737 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acta2P62737 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acta2P62737 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acta2P62737 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Acta2P62737 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Acta2P62737 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Acta2P62737 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Acta2P62737 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Acta2P62737 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Acta2P62737 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Acta2P62737 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Acta2P62737 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Acta2P62737 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Acta2P62737 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Acta2P62737 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Acta2P62737 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Acta2P62737 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Acta2P62737 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Acta2P62737 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Acta2P62737 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Acta2P62737 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Acta2P62737 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Acta2P62737 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Acta2P62737 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Acta2P62737 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Acta2P62737 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Acta2P62737 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Acta2P62737 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Acta2P62737 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Acta2P62737 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Acta2P62737 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Acta2P62737 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Acta2P62737 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Acta2P62737 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Acta2P62737 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Acta2P62737 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Acta2P62737 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Acta2P62737 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Acta2P62737 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Acta2P62737 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Acta2P62737 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Acta2P62737 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Acta2P62737 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Acta2P62737 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Acta2P62737 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Acta2P62737 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Acta2P62737 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Acta2P62737 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Acta2P62737 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Acta2P62737 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Acta2P62737 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Acta2P62737 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Acta2P62737 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Acta2P62737 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Acta2P62737 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Acta2P62737 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Acta2P62737 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Acta2P62737 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Acta2P62737 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Acta2P62737 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Acta2P62737 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Acta2P62737 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Acta2P62737 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Acta2P62737 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Acta2P62737 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Acta2P62737 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Acta2P62737 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Acta2P62737 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Acta2P62737 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Acta2P62737 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Acta2P62737 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Acta2P62737 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Acta2P62737 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Acta2P62737 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms