Protein–RNA interactions for Protein: P62492

Rab11a, Ras-related protein Rab-11A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11aP62492 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab11aP62492 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab11aP62492 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab11aP62492 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab11aP62492 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab11aP62492 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab11aP62492 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab11aP62492 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab11aP62492 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab11aP62492 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab11aP62492 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab11aP62492 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab11aP62492 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab11aP62492 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab11aP62492 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab11aP62492 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab11aP62492 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab11aP62492 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab11aP62492 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab11aP62492 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab11aP62492 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab11aP62492 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab11aP62492 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab11aP62492 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab11aP62492 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab11aP62492 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab11aP62492 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab11aP62492 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab11aP62492 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab11aP62492 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11aP62492 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11aP62492 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11aP62492 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11aP62492 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11aP62492 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11aP62492 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11aP62492 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11aP62492 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11aP62492 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11aP62492 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11aP62492 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11aP62492 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11aP62492 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11aP62492 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11aP62492 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11aP62492 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab11aP62492 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab11aP62492 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab11aP62492 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab11aP62492 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab11aP62492 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab11aP62492 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab11aP62492 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab11aP62492 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab11aP62492 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab11aP62492 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab11aP62492 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab11aP62492 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab11aP62492 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab11aP62492 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab11aP62492 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab11aP62492 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab11aP62492 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab11aP62492 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab11aP62492 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab11aP62492 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab11aP62492 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab11aP62492 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab11aP62492 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab11aP62492 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab11aP62492 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab11aP62492 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab11aP62492 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab11aP62492 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab11aP62492 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab11aP62492 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab11aP62492 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab11aP62492 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab11aP62492 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab11aP62492 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms