Protein–RNA interactions for Protein: P62334

Psmc6, 26S proteasome regulatory subunit 10B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc6P62334 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psmc6P62334 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Psmc6P62334 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Psmc6P62334 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Psmc6P62334 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psmc6P62334 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psmc6P62334 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psmc6P62334 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Psmc6P62334 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Psmc6P62334 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psmc6P62334 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psmc6P62334 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psmc6P62334 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psmc6P62334 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psmc6P62334 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psmc6P62334 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psmc6P62334 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psmc6P62334 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psmc6P62334 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psmc6P62334 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psmc6P62334 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psmc6P62334 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psmc6P62334 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psmc6P62334 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psmc6P62334 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psmc6P62334 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psmc6P62334 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psmc6P62334 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Psmc6P62334 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Psmc6P62334 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Psmc6P62334 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Psmc6P62334 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Psmc6P62334 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Psmc6P62334 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Psmc6P62334 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Psmc6P62334 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psmc6P62334 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psmc6P62334 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psmc6P62334 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psmc6P62334 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psmc6P62334 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psmc6P62334 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psmc6P62334 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psmc6P62334 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psmc6P62334 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psmc6P62334 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psmc6P62334 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psmc6P62334 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psmc6P62334 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psmc6P62334 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psmc6P62334 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psmc6P62334 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psmc6P62334 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psmc6P62334 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psmc6P62334 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psmc6P62334 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psmc6P62334 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psmc6P62334 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Psmc6P62334 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Psmc6P62334 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Psmc6P62334 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Psmc6P62334 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Psmc6P62334 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Psmc6P62334 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Psmc6P62334 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Psmc6P62334 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Psmc6P62334 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Psmc6P62334 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Psmc6P62334 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Psmc6P62334 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Psmc6P62334 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Psmc6P62334 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Psmc6P62334 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Psmc6P62334 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Psmc6P62334 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Psmc6P62334 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Psmc6P62334 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Psmc6P62334 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Psmc6P62334 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Psmc6P62334 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Psmc6P62334 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psmc6P62334 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psmc6P62334 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psmc6P62334 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psmc6P62334 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psmc6P62334 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psmc6P62334 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psmc6P62334 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psmc6P62334 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psmc6P62334 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psmc6P62334 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Psmc6P62334 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Psmc6P62334 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Psmc6P62334 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Psmc6P62334 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Psmc6P62334 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Psmc6P62334 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Psmc6P62334 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Psmc6P62334 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Psmc6P62334 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms