Protein–RNA interactions for Protein: P62331

Arf6, ADP-ribosylation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf6P62331 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arf6P62331 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arf6P62331 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arf6P62331 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arf6P62331 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arf6P62331 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arf6P62331 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arf6P62331 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arf6P62331 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arf6P62331 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arf6P62331 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arf6P62331 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arf6P62331 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arf6P62331 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arf6P62331 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arf6P62331 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arf6P62331 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Arf6P62331 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arf6P62331 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arf6P62331 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arf6P62331 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arf6P62331 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arf6P62331 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arf6P62331 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arf6P62331 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arf6P62331 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arf6P62331 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arf6P62331 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arf6P62331 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arf6P62331 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arf6P62331 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arf6P62331 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arf6P62331 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arf6P62331 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arf6P62331 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arf6P62331 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arf6P62331 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arf6P62331 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arf6P62331 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arf6P62331 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arf6P62331 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arf6P62331 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arf6P62331 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arf6P62331 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Arf6P62331 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arf6P62331 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arf6P62331 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arf6P62331 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arf6P62331 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arf6P62331 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arf6P62331 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arf6P62331 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Arf6P62331 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Arf6P62331 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arf6P62331 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arf6P62331 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arf6P62331 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arf6P62331 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arf6P62331 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arf6P62331 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arf6P62331 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arf6P62331 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arf6P62331 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arf6P62331 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arf6P62331 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arf6P62331 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arf6P62331 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arf6P62331 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arf6P62331 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arf6P62331 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arf6P62331 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arf6P62331 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arf6P62331 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arf6P62331 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Arf6P62331 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arf6P62331 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Arf6P62331 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arf6P62331 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arf6P62331 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Arf6P62331 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arf6P62331 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arf6P62331 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Arf6P62331 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arf6P62331 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arf6P62331 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arf6P62331 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arf6P62331 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arf6P62331 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arf6P62331 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arf6P62331 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Arf6P62331 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arf6P62331 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arf6P62331 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arf6P62331 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arf6P62331 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arf6P62331 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arf6P62331 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arf6P62331 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arf6P62331 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arf6P62331 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms