Protein–RNA interactions for Protein: P62305

Snrpe, Small nuclear ribonucleoprotein E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpeP62305 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms