Protein–RNA interactions for Protein: P62046

Lrch1, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch1P62046 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrch1P62046 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrch1P62046 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrch1P62046 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrch1P62046 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrch1P62046 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrch1P62046 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrch1P62046 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrch1P62046 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrch1P62046 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrch1P62046 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrch1P62046 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrch1P62046 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrch1P62046 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrch1P62046 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrch1P62046 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrch1P62046 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrch1P62046 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrch1P62046 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrch1P62046 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrch1P62046 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrch1P62046 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrch1P62046 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrch1P62046 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrch1P62046 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrch1P62046 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrch1P62046 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrch1P62046 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrch1P62046 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrch1P62046 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrch1P62046 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrch1P62046 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrch1P62046 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrch1P62046 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrch1P62046 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrch1P62046 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrch1P62046 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrch1P62046 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrch1P62046 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrch1P62046 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrch1P62046 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrch1P62046 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrch1P62046 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrch1P62046 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrch1P62046 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrch1P62046 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrch1P62046 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrch1P62046 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrch1P62046 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrch1P62046 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrch1P62046 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrch1P62046 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrch1P62046 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrch1P62046 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrch1P62046 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrch1P62046 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrch1P62046 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrch1P62046 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrch1P62046 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrch1P62046 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrch1P62046 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrch1P62046 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrch1P62046 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrch1P62046 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrch1P62046 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrch1P62046 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrch1P62046 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrch1P62046 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrch1P62046 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrch1P62046 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrch1P62046 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrch1P62046 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrch1P62046 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrch1P62046 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrch1P62046 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrch1P62046 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrch1P62046 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrch1P62046 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrch1P62046 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrch1P62046 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrch1P62046 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrch1P62046 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrch1P62046 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrch1P62046 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrch1P62046 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrch1P62046 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrch1P62046 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrch1P62046 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrch1P62046 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrch1P62046 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrch1P62046 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrch1P62046 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrch1P62046 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrch1P62046 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrch1P62046 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrch1P62046 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Lrch1P62046 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrch1P62046 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrch1P62046 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrch1P62046 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms