Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vbp1P61759 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vbp1P61759 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vbp1P61759 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vbp1P61759 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vbp1P61759 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vbp1P61759 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vbp1P61759 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vbp1P61759 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vbp1P61759 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vbp1P61759 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vbp1P61759 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vbp1P61759 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vbp1P61759 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vbp1P61759 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vbp1P61759 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vbp1P61759 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vbp1P61759 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vbp1P61759 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vbp1P61759 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vbp1P61759 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vbp1P61759 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vbp1P61759 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vbp1P61759 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vbp1P61759 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vbp1P61759 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Vbp1P61759 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vbp1P61759 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vbp1P61759 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vbp1P61759 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vbp1P61759 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vbp1P61759 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vbp1P61759 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vbp1P61759 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vbp1P61759 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vbp1P61759 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Vbp1P61759 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vbp1P61759 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Vbp1P61759 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vbp1P61759 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vbp1P61759 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vbp1P61759 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vbp1P61759 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vbp1P61759 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vbp1P61759 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vbp1P61759 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vbp1P61759 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vbp1P61759 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vbp1P61759 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vbp1P61759 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Vbp1P61759 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vbp1P61759 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms