Protein–RNA interactions for Protein: P61588

Rnd3, Rho-related GTP-binding protein RhoE, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnd3P61588 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnd3P61588 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnd3P61588 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnd3P61588 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnd3P61588 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnd3P61588 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnd3P61588 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnd3P61588 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnd3P61588 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnd3P61588 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnd3P61588 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms