Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Smg6P61406 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Smg6P61406 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Smg6P61406 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Smg6P61406 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Smg6P61406 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Smg6P61406 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Smg6P61406 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Smg6P61406 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Smg6P61406 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Smg6P61406 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Smg6P61406 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Smg6P61406 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Smg6P61406 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Smg6P61406 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Smg6P61406 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Smg6P61406 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Smg6P61406 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Smg6P61406 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Smg6P61406 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Smg6P61406 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Smg6P61406 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Smg6P61406 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Smg6P61406 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Smg6P61406 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Smg6P61406 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Smg6P61406 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Smg6P61406 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Smg6P61406 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Smg6P61406 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Smg6P61406 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Smg6P61406 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Smg6P61406 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Smg6P61406 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Smg6P61406 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Smg6P61406 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Smg6P61406 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Smg6P61406 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Smg6P61406 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Smg6P61406 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Smg6P61406 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Smg6P61406 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Smg6P61406 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Smg6P61406 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Smg6P61406 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Smg6P61406 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Smg6P61406 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Smg6P61406 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Smg6P61406 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Smg6P61406 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Smg6P61406 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Smg6P61406 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Smg6P61406 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Smg6P61406 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Smg6P61406 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Smg6P61406 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Smg6P61406 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Smg6P61406 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Smg6P61406 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Smg6P61406 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Smg6P61406 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Smg6P61406 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Smg6P61406 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Smg6P61406 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Smg6P61406 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Smg6P61406 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Smg6P61406 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Smg6P61406 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Smg6P61406 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Smg6P61406 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Smg6P61406 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Smg6P61406 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Smg6P61406 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Smg6P61406 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Smg6P61406 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Smg6P61406 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Smg6P61406 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Smg6P61406 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Smg6P61406 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Smg6P61406 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Smg6P61406 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Smg6P61406 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Smg6P61406 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Smg6P61406 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Smg6P61406 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Smg6P61406 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Smg6P61406 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Smg6P61406 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Smg6P61406 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Smg6P61406 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Smg6P61406 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Smg6P61406 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Smg6P61406 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Smg6P61406 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Smg6P61406 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Smg6P61406 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Smg6P61406 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Smg6P61406 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Smg6P61406 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Smg6P61406 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms