Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2d1P61080 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2d1P61080 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2d1P61080 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2d1P61080 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2d1P61080 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2d1P61080 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2d1P61080 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2d1P61080 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2d1P61080 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2d1P61080 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2d1P61080 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2d1P61080 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2d1P61080 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2d1P61080 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2d1P61080 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2d1P61080 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2d1P61080 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2d1P61080 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2d1P61080 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2d1P61080 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2d1P61080 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2d1P61080 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2d1P61080 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2d1P61080 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2d1P61080 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2d1P61080 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2d1P61080 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2d1P61080 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2d1P61080 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2d1P61080 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2d1P61080 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2d1P61080 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2d1P61080 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2d1P61080 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2d1P61080 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2d1P61080 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2d1P61080 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2d1P61080 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2d1P61080 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2d1P61080 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2d1P61080 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2d1P61080 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2d1P61080 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2d1P61080 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2d1P61080 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2d1P61080 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2d1P61080 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2d1P61080 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2d1P61080 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2d1P61080 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2d1P61080 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2d1P61080 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2d1P61080 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2d1P61080 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2d1P61080 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2d1P61080 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2d1P61080 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2d1P61080 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2d1P61080 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2d1P61080 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2d1P61080 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2d1P61080 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2d1P61080 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2d1P61080 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2d1P61080 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2d1P61080 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2d1P61080 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2d1P61080 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2d1P61080 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2d1P61080 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2d1P61080 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2d1P61080 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2d1P61080 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2d1P61080 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2d1P61080 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2d1P61080 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2d1P61080 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2d1P61080 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2d1P61080 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ube2d1P61080 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ube2d1P61080 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ube2d1P61080 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2d1P61080 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2d1P61080 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2d1P61080 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2d1P61080 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2d1P61080 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2d1P61080 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2d1P61080 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2d1P61080 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2d1P61080 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2d1P61080 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2d1P61080 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2d1P61080 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2d1P61080 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2d1P61080 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2d1P61080 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2d1P61080 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2d1P61080 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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