Protein–RNA interactions for Protein: P61021

Rab5b, Ras-related protein Rab-5B, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5bP61021 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab5bP61021 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab5bP61021 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab5bP61021 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab5bP61021 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab5bP61021 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab5bP61021 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab5bP61021 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab5bP61021 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab5bP61021 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab5bP61021 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab5bP61021 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab5bP61021 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab5bP61021 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab5bP61021 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab5bP61021 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab5bP61021 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab5bP61021 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab5bP61021 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab5bP61021 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab5bP61021 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab5bP61021 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab5bP61021 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab5bP61021 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab5bP61021 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab5bP61021 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab5bP61021 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab5bP61021 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab5bP61021 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab5bP61021 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab5bP61021 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab5bP61021 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab5bP61021 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab5bP61021 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab5bP61021 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab5bP61021 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab5bP61021 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab5bP61021 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab5bP61021 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab5bP61021 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab5bP61021 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab5bP61021 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab5bP61021 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab5bP61021 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab5bP61021 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab5bP61021 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab5bP61021 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab5bP61021 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab5bP61021 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab5bP61021 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab5bP61021 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab5bP61021 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab5bP61021 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab5bP61021 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab5bP61021 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab5bP61021 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab5bP61021 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab5bP61021 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab5bP61021 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab5bP61021 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab5bP61021 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab5bP61021 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab5bP61021 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab5bP61021 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab5bP61021 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab5bP61021 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab5bP61021 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab5bP61021 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab5bP61021 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab5bP61021 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab5bP61021 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab5bP61021 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab5bP61021 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab5bP61021 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab5bP61021 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab5bP61021 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab5bP61021 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab5bP61021 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab5bP61021 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab5bP61021 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab5bP61021 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab5bP61021 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab5bP61021 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab5bP61021 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab5bP61021 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab5bP61021 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab5bP61021 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab5bP61021 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab5bP61021 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab5bP61021 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab5bP61021 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab5bP61021 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab5bP61021 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab5bP61021 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab5bP61021 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab5bP61021 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab5bP61021 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab5bP61021 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab5bP61021 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab5bP61021 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms