Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppfia3P60469 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppfia3P60469 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppfia3P60469 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppfia3P60469 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppfia3P60469 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppfia3P60469 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppfia3P60469 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppfia3P60469 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppfia3P60469 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppfia3P60469 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppfia3P60469 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppfia3P60469 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppfia3P60469 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppfia3P60469 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppfia3P60469 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppfia3P60469 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppfia3P60469 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppfia3P60469 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppfia3P60469 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppfia3P60469 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppfia3P60469 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppfia3P60469 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppfia3P60469 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppfia3P60469 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppfia3P60469 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppfia3P60469 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppfia3P60469 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppfia3P60469 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppfia3P60469 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppfia3P60469 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppfia3P60469 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppfia3P60469 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppfia3P60469 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppfia3P60469 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppfia3P60469 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppfia3P60469 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppfia3P60469 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppfia3P60469 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppfia3P60469 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppfia3P60469 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppfia3P60469 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppfia3P60469 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppfia3P60469 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppfia3P60469 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppfia3P60469 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppfia3P60469 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppfia3P60469 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppfia3P60469 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppfia3P60469 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppfia3P60469 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppfia3P60469 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Ppfia3P60469 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ppfia3P60469 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ppfia3P60469 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ppfia3P60469 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppfia3P60469 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppfia3P60469 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppfia3P60469 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppfia3P60469 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppfia3P60469 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppfia3P60469 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppfia3P60469 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppfia3P60469 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppfia3P60469 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppfia3P60469 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppfia3P60469 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppfia3P60469 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppfia3P60469 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppfia3P60469 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppfia3P60469 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppfia3P60469 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppfia3P60469 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppfia3P60469 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppfia3P60469 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppfia3P60469 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppfia3P60469 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppfia3P60469 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppfia3P60469 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppfia3P60469 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppfia3P60469 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppfia3P60469 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppfia3P60469 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppfia3P60469 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppfia3P60469 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppfia3P60469 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppfia3P60469 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppfia3P60469 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppfia3P60469 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppfia3P60469 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppfia3P60469 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppfia3P60469 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppfia3P60469 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppfia3P60469 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppfia3P60469 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppfia3P60469 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppfia3P60469 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppfia3P60469 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppfia3P60469 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppfia3P60469 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms