Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Paxbp1P58501 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Paxbp1P58501 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Paxbp1P58501 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Paxbp1P58501 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Paxbp1P58501 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Paxbp1P58501 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Paxbp1P58501 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Paxbp1P58501 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Paxbp1P58501 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Paxbp1P58501 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Paxbp1P58501 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Paxbp1P58501 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Paxbp1P58501 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Paxbp1P58501 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Paxbp1P58501 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Paxbp1P58501 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Paxbp1P58501 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Paxbp1P58501 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Paxbp1P58501 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Paxbp1P58501 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Paxbp1P58501 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Paxbp1P58501 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Paxbp1P58501 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Paxbp1P58501 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Paxbp1P58501 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Paxbp1P58501 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Paxbp1P58501 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Paxbp1P58501 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Paxbp1P58501 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Paxbp1P58501 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Paxbp1P58501 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Paxbp1P58501 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Paxbp1P58501 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Paxbp1P58501 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Paxbp1P58501 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Paxbp1P58501 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Paxbp1P58501 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Paxbp1P58501 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Paxbp1P58501 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Paxbp1P58501 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Paxbp1P58501 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Paxbp1P58501 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Paxbp1P58501 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Paxbp1P58501 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Paxbp1P58501 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Paxbp1P58501 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Paxbp1P58501 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Paxbp1P58501 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Paxbp1P58501 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Paxbp1P58501 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Paxbp1P58501 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Paxbp1P58501 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Paxbp1P58501 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Paxbp1P58501 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Paxbp1P58501 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Paxbp1P58501 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Paxbp1P58501 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Paxbp1P58501 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Paxbp1P58501 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Paxbp1P58501 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Paxbp1P58501 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Paxbp1P58501 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Paxbp1P58501 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Paxbp1P58501 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Paxbp1P58501 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Paxbp1P58501 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Paxbp1P58501 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Paxbp1P58501 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Paxbp1P58501 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Paxbp1P58501 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Paxbp1P58501 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Paxbp1P58501 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Paxbp1P58501 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Paxbp1P58501 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Paxbp1P58501 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Paxbp1P58501 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Paxbp1P58501 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Paxbp1P58501 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Paxbp1P58501 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Paxbp1P58501 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Paxbp1P58501 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Paxbp1P58501 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Paxbp1P58501 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Paxbp1P58501 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Paxbp1P58501 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Paxbp1P58501 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Paxbp1P58501 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Paxbp1P58501 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Paxbp1P58501 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Paxbp1P58501 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Paxbp1P58501 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Paxbp1P58501 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Paxbp1P58501 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Paxbp1P58501 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Paxbp1P58501 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Paxbp1P58501 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Paxbp1P58501 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Paxbp1P58501 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Paxbp1P58501 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms