Protein–RNA interactions for Protein: P58006

Sesn1, Sestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sesn1P58006 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sesn1P58006 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sesn1P58006 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sesn1P58006 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sesn1P58006 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sesn1P58006 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sesn1P58006 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sesn1P58006 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sesn1P58006 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sesn1P58006 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sesn1P58006 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sesn1P58006 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sesn1P58006 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sesn1P58006 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sesn1P58006 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sesn1P58006 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sesn1P58006 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sesn1P58006 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sesn1P58006 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sesn1P58006 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sesn1P58006 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sesn1P58006 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sesn1P58006 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sesn1P58006 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sesn1P58006 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sesn1P58006 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sesn1P58006 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sesn1P58006 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sesn1P58006 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sesn1P58006 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sesn1P58006 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sesn1P58006 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sesn1P58006 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sesn1P58006 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sesn1P58006 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sesn1P58006 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sesn1P58006 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sesn1P58006 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sesn1P58006 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sesn1P58006 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sesn1P58006 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sesn1P58006 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sesn1P58006 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sesn1P58006 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sesn1P58006 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sesn1P58006 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sesn1P58006 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sesn1P58006 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sesn1P58006 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sesn1P58006 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sesn1P58006 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sesn1P58006 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sesn1P58006 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sesn1P58006 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sesn1P58006 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sesn1P58006 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sesn1P58006 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sesn1P58006 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sesn1P58006 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sesn1P58006 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sesn1P58006 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sesn1P58006 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sesn1P58006 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sesn1P58006 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sesn1P58006 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sesn1P58006 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sesn1P58006 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sesn1P58006 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sesn1P58006 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sesn1P58006 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sesn1P58006 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sesn1P58006 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sesn1P58006 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sesn1P58006 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sesn1P58006 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sesn1P58006 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sesn1P58006 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sesn1P58006 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sesn1P58006 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sesn1P58006 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sesn1P58006 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sesn1P58006 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sesn1P58006 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sesn1P58006 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sesn1P58006 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sesn1P58006 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sesn1P58006 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sesn1P58006 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sesn1P58006 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sesn1P58006 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sesn1P58006 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sesn1P58006 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sesn1P58006 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sesn1P58006 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sesn1P58006 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sesn1P58006 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sesn1P58006 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sesn1P58006 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sesn1P58006 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sesn1P58006 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms