Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snrpa1P57784 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snrpa1P57784 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snrpa1P57784 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snrpa1P57784 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snrpa1P57784 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Snrpa1P57784 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snrpa1P57784 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snrpa1P57784 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snrpa1P57784 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snrpa1P57784 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snrpa1P57784 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snrpa1P57784 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snrpa1P57784 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snrpa1P57784 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snrpa1P57784 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snrpa1P57784 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snrpa1P57784 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snrpa1P57784 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snrpa1P57784 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snrpa1P57784 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snrpa1P57784 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snrpa1P57784 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snrpa1P57784 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Snrpa1P57784 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snrpa1P57784 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snrpa1P57784 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snrpa1P57784 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Snrpa1P57784 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Snrpa1P57784 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Snrpa1P57784 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Snrpa1P57784 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Snrpa1P57784 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Snrpa1P57784 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Snrpa1P57784 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Snrpa1P57784 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snrpa1P57784 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snrpa1P57784 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snrpa1P57784 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snrpa1P57784 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snrpa1P57784 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snrpa1P57784 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snrpa1P57784 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Snrpa1P57784 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snrpa1P57784 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snrpa1P57784 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snrpa1P57784 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snrpa1P57784 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snrpa1P57784 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snrpa1P57784 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Snrpa1P57784 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snrpa1P57784 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Snrpa1P57784 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snrpa1P57784 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snrpa1P57784 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snrpa1P57784 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snrpa1P57784 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snrpa1P57784 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Snrpa1P57784 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snrpa1P57784 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snrpa1P57784 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snrpa1P57784 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snrpa1P57784 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snrpa1P57784 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snrpa1P57784 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snrpa1P57784 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snrpa1P57784 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snrpa1P57784 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snrpa1P57784 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snrpa1P57784 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snrpa1P57784 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Snrpa1P57784 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snrpa1P57784 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snrpa1P57784 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snrpa1P57784 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snrpa1P57784 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snrpa1P57784 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snrpa1P57784 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Snrpa1P57784 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Snrpa1P57784 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Snrpa1P57784 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Snrpa1P57784 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Snrpa1P57784 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snrpa1P57784 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snrpa1P57784 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snrpa1P57784 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snrpa1P57784 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snrpa1P57784 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snrpa1P57784 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snrpa1P57784 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Snrpa1P57784 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snrpa1P57784 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snrpa1P57784 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snrpa1P57784 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snrpa1P57784 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snrpa1P57784 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snrpa1P57784 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snrpa1P57784 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Snrpa1P57784 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snrpa1P57784 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms