Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TdgP56581 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TdgP56581 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TdgP56581 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TdgP56581 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TdgP56581 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TdgP56581 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TdgP56581 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TdgP56581 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TdgP56581 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TdgP56581 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TdgP56581 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TdgP56581 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TdgP56581 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TdgP56581 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TdgP56581 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TdgP56581 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TdgP56581 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TdgP56581 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TdgP56581 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TdgP56581 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.33■■□□□ 1
TdgP56581 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TdgP56581 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TdgP56581 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TdgP56581 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TdgP56581 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TdgP56581 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TdgP56581 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TdgP56581 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TdgP56581 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TdgP56581 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TdgP56581 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TdgP56581 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TdgP56581 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TdgP56581 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TdgP56581 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TdgP56581 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TdgP56581 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TdgP56581 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TdgP56581 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TdgP56581 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.3■■□□□ 1
TdgP56581 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TdgP56581 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TdgP56581 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TdgP56581 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TdgP56581 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TdgP56581 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TdgP56581 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TdgP56581 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TdgP56581 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TdgP56581 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TdgP56581 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TdgP56581 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TdgP56581 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TdgP56581 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TdgP56581 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TdgP56581 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TdgP56581 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TdgP56581 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TdgP56581 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TdgP56581 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TdgP56581 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TdgP56581 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TdgP56581 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TdgP56581 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TdgP56581 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TdgP56581 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TdgP56581 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TdgP56581 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TdgP56581 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TdgP56581 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TdgP56581 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TdgP56581 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TdgP56581 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TdgP56581 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TdgP56581 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TdgP56581 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TdgP56581 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TdgP56581 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TdgP56581 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TdgP56581 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TdgP56581 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TdgP56581 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TdgP56581 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TdgP56581 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TdgP56581 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TdgP56581 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TdgP56581 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TdgP56581 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TdgP56581 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TdgP56581 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TdgP56581 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TdgP56581 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TdgP56581 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TdgP56581 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TdgP56581 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TdgP56581 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TdgP56581 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TdgP56581 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TdgP56581 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms