Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rrp1P56183 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rrp1P56183 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rrp1P56183 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rrp1P56183 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rrp1P56183 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rrp1P56183 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rrp1P56183 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrp1P56183 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrp1P56183 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrp1P56183 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrp1P56183 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrp1P56183 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrp1P56183 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrp1P56183 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrp1P56183 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrp1P56183 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrp1P56183 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrp1P56183 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrp1P56183 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrp1P56183 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrp1P56183 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrp1P56183 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrp1P56183 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrp1P56183 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrp1P56183 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrp1P56183 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrp1P56183 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrp1P56183 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrp1P56183 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rrp1P56183 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rrp1P56183 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rrp1P56183 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rrp1P56183 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rrp1P56183 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rrp1P56183 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rrp1P56183 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rrp1P56183 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rrp1P56183 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rrp1P56183 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rrp1P56183 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rrp1P56183 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rrp1P56183 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rrp1P56183 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rrp1P56183 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rrp1P56183 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rrp1P56183 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rrp1P56183 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rrp1P56183 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rrp1P56183 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rrp1P56183 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rrp1P56183 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rrp1P56183 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rrp1P56183 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rrp1P56183 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rrp1P56183 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rrp1P56183 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rrp1P56183 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rrp1P56183 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rrp1P56183 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rrp1P56183 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rrp1P56183 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rrp1P56183 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rrp1P56183 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rrp1P56183 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rrp1P56183 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rrp1P56183 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rrp1P56183 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rrp1P56183 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rrp1P56183 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rrp1P56183 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rrp1P56183 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rrp1P56183 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rrp1P56183 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rrp1P56183 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rrp1P56183 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rrp1P56183 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rrp1P56183 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rrp1P56183 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rrp1P56183 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rrp1P56183 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rrp1P56183 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rrp1P56183 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rrp1P56183 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rrp1P56183 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rrp1P56183 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rrp1P56183 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rrp1P56183 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rrp1P56183 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rrp1P56183 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rrp1P56183 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rrp1P56183 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rrp1P56183 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rrp1P56183 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rrp1P56183 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rrp1P56183 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rrp1P56183 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rrp1P56183 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rrp1P56183 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rrp1P56183 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms