Protein–RNA interactions for Protein: P54987

Acod1, Cis-aconitate decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acod1P54987 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Acod1P54987 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Acod1P54987 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Acod1P54987 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Acod1P54987 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Acod1P54987 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Acod1P54987 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Acod1P54987 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Acod1P54987 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Acod1P54987 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Acod1P54987 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Acod1P54987 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Acod1P54987 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Acod1P54987 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Acod1P54987 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Acod1P54987 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Acod1P54987 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Acod1P54987 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Acod1P54987 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Acod1P54987 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Acod1P54987 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Acod1P54987 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Acod1P54987 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Acod1P54987 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Acod1P54987 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Acod1P54987 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Acod1P54987 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Acod1P54987 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Acod1P54987 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Acod1P54987 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Acod1P54987 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Acod1P54987 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Acod1P54987 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Acod1P54987 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Acod1P54987 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Acod1P54987 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Acod1P54987 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Acod1P54987 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Acod1P54987 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Acod1P54987 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Acod1P54987 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Acod1P54987 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Acod1P54987 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Acod1P54987 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Acod1P54987 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Acod1P54987 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Acod1P54987 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Acod1P54987 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Acod1P54987 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Acod1P54987 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Acod1P54987 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Acod1P54987 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Acod1P54987 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Acod1P54987 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Acod1P54987 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Acod1P54987 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Acod1P54987 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Acod1P54987 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Acod1P54987 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Acod1P54987 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Acod1P54987 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Acod1P54987 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Acod1P54987 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Acod1P54987 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Acod1P54987 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Acod1P54987 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Acod1P54987 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Acod1P54987 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Acod1P54987 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Acod1P54987 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Acod1P54987 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Acod1P54987 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Acod1P54987 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Acod1P54987 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Acod1P54987 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Acod1P54987 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Acod1P54987 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Acod1P54987 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Acod1P54987 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Acod1P54987 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Acod1P54987 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Acod1P54987 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Acod1P54987 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Acod1P54987 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Acod1P54987 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Acod1P54987 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Acod1P54987 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Acod1P54987 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Acod1P54987 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Acod1P54987 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Acod1P54987 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Acod1P54987 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Acod1P54987 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Acod1P54987 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Acod1P54987 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Acod1P54987 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Acod1P54987 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Acod1P54987 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Acod1P54987 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Acod1P54987 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms