Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacnb3P54285 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacnb3P54285 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacnb3P54285 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacnb3P54285 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacnb3P54285 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacnb3P54285 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacnb3P54285 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacnb3P54285 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacnb3P54285 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacnb3P54285 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacnb3P54285 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacnb3P54285 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacnb3P54285 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacnb3P54285 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacnb3P54285 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacnb3P54285 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacnb3P54285 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacnb3P54285 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacnb3P54285 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacnb3P54285 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacnb3P54285 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacnb3P54285 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacnb3P54285 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacnb3P54285 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacnb3P54285 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacnb3P54285 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacnb3P54285 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacnb3P54285 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacnb3P54285 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacnb3P54285 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacnb3P54285 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacnb3P54285 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cacnb3P54285 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cacnb3P54285 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cacnb3P54285 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cacnb3P54285 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Cacnb3P54285 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cacnb3P54285 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cacnb3P54285 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cacnb3P54285 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cacnb3P54285 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cacnb3P54285 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cacnb3P54285 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Cacnb3P54285 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cacnb3P54285 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Cacnb3P54285 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cacnb3P54285 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Cacnb3P54285 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cacnb3P54285 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cacnb3P54285 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cacnb3P54285 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cacnb3P54285 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cacnb3P54285 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cacnb3P54285 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cacnb3P54285 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cacnb3P54285 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cacnb3P54285 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cacnb3P54285 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cacnb3P54285 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cacnb3P54285 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cacnb3P54285 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cacnb3P54285 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cacnb3P54285 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cacnb3P54285 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cacnb3P54285 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cacnb3P54285 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cacnb3P54285 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cacnb3P54285 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cacnb3P54285 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cacnb3P54285 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cacnb3P54285 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cacnb3P54285 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cacnb3P54285 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cacnb3P54285 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cacnb3P54285 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cacnb3P54285 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cacnb3P54285 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cacnb3P54285 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cacnb3P54285 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cacnb3P54285 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cacnb3P54285 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cacnb3P54285 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cacnb3P54285 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cacnb3P54285 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cacnb3P54285 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cacnb3P54285 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cacnb3P54285 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cacnb3P54285 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cacnb3P54285 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cacnb3P54285 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cacnb3P54285 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cacnb3P54285 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cacnb3P54285 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cacnb3P54285 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cacnb3P54285 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cacnb3P54285 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Cacnb3P54285 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cacnb3P54285 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cacnb3P54285 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms