Protein–RNA interactions for Protein: P53395

Dbt, Lipoamide acyltransferase component of branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase complex, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbtP53395 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DbtP53395 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DbtP53395 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DbtP53395 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DbtP53395 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DbtP53395 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DbtP53395 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DbtP53395 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DbtP53395 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DbtP53395 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DbtP53395 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DbtP53395 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DbtP53395 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DbtP53395 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DbtP53395 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DbtP53395 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DbtP53395 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DbtP53395 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DbtP53395 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
DbtP53395 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DbtP53395 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DbtP53395 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DbtP53395 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DbtP53395 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DbtP53395 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DbtP53395 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DbtP53395 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DbtP53395 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DbtP53395 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DbtP53395 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DbtP53395 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DbtP53395 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
DbtP53395 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DbtP53395 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DbtP53395 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DbtP53395 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DbtP53395 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DbtP53395 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DbtP53395 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DbtP53395 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DbtP53395 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DbtP53395 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DbtP53395 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
DbtP53395 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DbtP53395 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DbtP53395 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DbtP53395 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DbtP53395 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DbtP53395 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DbtP53395 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DbtP53395 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DbtP53395 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DbtP53395 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DbtP53395 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DbtP53395 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DbtP53395 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DbtP53395 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DbtP53395 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DbtP53395 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DbtP53395 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DbtP53395 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DbtP53395 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DbtP53395 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DbtP53395 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DbtP53395 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DbtP53395 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DbtP53395 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DbtP53395 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
DbtP53395 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DbtP53395 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DbtP53395 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DbtP53395 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DbtP53395 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DbtP53395 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DbtP53395 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DbtP53395 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DbtP53395 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DbtP53395 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DbtP53395 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DbtP53395 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DbtP53395 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DbtP53395 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DbtP53395 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DbtP53395 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DbtP53395 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DbtP53395 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DbtP53395 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DbtP53395 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DbtP53395 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DbtP53395 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DbtP53395 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DbtP53395 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DbtP53395 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DbtP53395 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DbtP53395 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DbtP53395 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DbtP53395 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DbtP53395 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DbtP53395 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DbtP53395 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms