Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efnb1P52795 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efnb1P52795 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efnb1P52795 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efnb1P52795 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efnb1P52795 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efnb1P52795 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efnb1P52795 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efnb1P52795 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efnb1P52795 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efnb1P52795 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efnb1P52795 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efnb1P52795 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efnb1P52795 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efnb1P52795 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efnb1P52795 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Efnb1P52795 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efnb1P52795 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efnb1P52795 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efnb1P52795 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Efnb1P52795 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efnb1P52795 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efnb1P52795 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Efnb1P52795 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efnb1P52795 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efnb1P52795 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efnb1P52795 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efnb1P52795 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efnb1P52795 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efnb1P52795 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efnb1P52795 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efnb1P52795 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efnb1P52795 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efnb1P52795 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efnb1P52795 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efnb1P52795 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Efnb1P52795 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efnb1P52795 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efnb1P52795 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efnb1P52795 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Efnb1P52795 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efnb1P52795 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efnb1P52795 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efnb1P52795 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efnb1P52795 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efnb1P52795 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efnb1P52795 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Efnb1P52795 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efnb1P52795 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efnb1P52795 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Efnb1P52795 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Efnb1P52795 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Efnb1P52795 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Efnb1P52795 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Efnb1P52795 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Efnb1P52795 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Efnb1P52795 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Efnb1P52795 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Efnb1P52795 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Efnb1P52795 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Efnb1P52795 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Efnb1P52795 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Efnb1P52795 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Efnb1P52795 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Efnb1P52795 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Efnb1P52795 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Efnb1P52795 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Efnb1P52795 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms