Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TspoP50637 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TspoP50637 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TspoP50637 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TspoP50637 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TspoP50637 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TspoP50637 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TspoP50637 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TspoP50637 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TspoP50637 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TspoP50637 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TspoP50637 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TspoP50637 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TspoP50637 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TspoP50637 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TspoP50637 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TspoP50637 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TspoP50637 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TspoP50637 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TspoP50637 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TspoP50637 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TspoP50637 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TspoP50637 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TspoP50637 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TspoP50637 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TspoP50637 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TspoP50637 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TspoP50637 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TspoP50637 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TspoP50637 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TspoP50637 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TspoP50637 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TspoP50637 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TspoP50637 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TspoP50637 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TspoP50637 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TspoP50637 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TspoP50637 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TspoP50637 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TspoP50637 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TspoP50637 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TspoP50637 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TspoP50637 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TspoP50637 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TspoP50637 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TspoP50637 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TspoP50637 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TspoP50637 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TspoP50637 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TspoP50637 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TspoP50637 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TspoP50637 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TspoP50637 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TspoP50637 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TspoP50637 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TspoP50637 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TspoP50637 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TspoP50637 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TspoP50637 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TspoP50637 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TspoP50637 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TspoP50637 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TspoP50637 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TspoP50637 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TspoP50637 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TspoP50637 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TspoP50637 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TspoP50637 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TspoP50637 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TspoP50637 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TspoP50637 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TspoP50637 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TspoP50637 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TspoP50637 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TspoP50637 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TspoP50637 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TspoP50637 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TspoP50637 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TspoP50637 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TspoP50637 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TspoP50637 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TspoP50637 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TspoP50637 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TspoP50637 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TspoP50637 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TspoP50637 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TspoP50637 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TspoP50637 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TspoP50637 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TspoP50637 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TspoP50637 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TspoP50637 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TspoP50637 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TspoP50637 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TspoP50637 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TspoP50637 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TspoP50637 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TspoP50637 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TspoP50637 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TspoP50637 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms