Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FmodP50608 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FmodP50608 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
FmodP50608 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FmodP50608 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FmodP50608 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FmodP50608 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FmodP50608 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FmodP50608 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FmodP50608 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FmodP50608 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FmodP50608 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FmodP50608 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FmodP50608 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FmodP50608 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FmodP50608 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FmodP50608 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FmodP50608 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FmodP50608 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FmodP50608 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FmodP50608 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FmodP50608 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FmodP50608 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FmodP50608 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FmodP50608 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FmodP50608 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FmodP50608 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FmodP50608 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FmodP50608 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FmodP50608 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FmodP50608 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FmodP50608 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FmodP50608 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FmodP50608 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FmodP50608 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FmodP50608 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FmodP50608 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FmodP50608 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FmodP50608 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FmodP50608 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FmodP50608 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FmodP50608 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FmodP50608 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FmodP50608 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FmodP50608 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FmodP50608 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FmodP50608 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FmodP50608 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FmodP50608 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FmodP50608 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FmodP50608 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FmodP50608 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FmodP50608 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FmodP50608 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FmodP50608 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FmodP50608 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FmodP50608 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FmodP50608 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FmodP50608 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FmodP50608 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FmodP50608 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FmodP50608 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FmodP50608 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FmodP50608 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FmodP50608 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FmodP50608 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FmodP50608 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FmodP50608 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FmodP50608 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FmodP50608 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FmodP50608 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FmodP50608 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FmodP50608 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FmodP50608 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FmodP50608 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FmodP50608 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FmodP50608 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FmodP50608 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FmodP50608 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FmodP50608 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FmodP50608 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FmodP50608 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FmodP50608 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FmodP50608 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FmodP50608 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FmodP50608 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FmodP50608 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FmodP50608 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FmodP50608 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FmodP50608 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FmodP50608 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FmodP50608 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FmodP50608 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FmodP50608 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FmodP50608 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FmodP50608 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FmodP50608 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FmodP50608 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FmodP50608 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FmodP50608 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms