Protein–RNA interactions for Protein: P50220

Nkx2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-1P50220 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx2-1P50220 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms