Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rfx1P48377 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rfx1P48377 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rfx1P48377 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rfx1P48377 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rfx1P48377 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rfx1P48377 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rfx1P48377 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rfx1P48377 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rfx1P48377 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rfx1P48377 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rfx1P48377 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rfx1P48377 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rfx1P48377 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rfx1P48377 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rfx1P48377 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rfx1P48377 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rfx1P48377 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rfx1P48377 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rfx1P48377 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rfx1P48377 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rfx1P48377 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rfx1P48377 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rfx1P48377 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rfx1P48377 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rfx1P48377 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rfx1P48377 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rfx1P48377 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rfx1P48377 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rfx1P48377 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rfx1P48377 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rfx1P48377 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rfx1P48377 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rfx1P48377 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rfx1P48377 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rfx1P48377 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rfx1P48377 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rfx1P48377 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rfx1P48377 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rfx1P48377 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rfx1P48377 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rfx1P48377 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rfx1P48377 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rfx1P48377 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rfx1P48377 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rfx1P48377 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rfx1P48377 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rfx1P48377 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rfx1P48377 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rfx1P48377 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rfx1P48377 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rfx1P48377 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rfx1P48377 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rfx1P48377 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rfx1P48377 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rfx1P48377 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rfx1P48377 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rfx1P48377 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rfx1P48377 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rfx1P48377 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rfx1P48377 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rfx1P48377 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rfx1P48377 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rfx1P48377 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rfx1P48377 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rfx1P48377 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rfx1P48377 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rfx1P48377 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rfx1P48377 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rfx1P48377 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rfx1P48377 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rfx1P48377 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rfx1P48377 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rfx1P48377 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rfx1P48377 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rfx1P48377 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rfx1P48377 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rfx1P48377 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rfx1P48377 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rfx1P48377 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rfx1P48377 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rfx1P48377 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rfx1P48377 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rfx1P48377 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rfx1P48377 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rfx1P48377 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rfx1P48377 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rfx1P48377 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rfx1P48377 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Rfx1P48377 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rfx1P48377 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rfx1P48377 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rfx1P48377 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rfx1P48377 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rfx1P48377 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rfx1P48377 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rfx1P48377 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rfx1P48377 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rfx1P48377 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rfx1P48377 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms