Protein–RNA interactions for Protein: P47962

Rpl5, 60S ribosomal protein L5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl5P47962 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl5P47962 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl5P47962 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl5P47962 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl5P47962 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl5P47962 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl5P47962 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl5P47962 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl5P47962 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl5P47962 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl5P47962 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl5P47962 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl5P47962 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl5P47962 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl5P47962 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl5P47962 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl5P47962 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl5P47962 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl5P47962 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl5P47962 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl5P47962 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl5P47962 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl5P47962 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl5P47962 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl5P47962 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl5P47962 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl5P47962 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl5P47962 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl5P47962 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl5P47962 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl5P47962 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl5P47962 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl5P47962 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl5P47962 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl5P47962 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl5P47962 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl5P47962 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl5P47962 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl5P47962 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl5P47962 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl5P47962 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl5P47962 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl5P47962 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl5P47962 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl5P47962 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl5P47962 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rpl5P47962 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl5P47962 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl5P47962 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl5P47962 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl5P47962 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl5P47962 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl5P47962 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl5P47962 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl5P47962 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl5P47962 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl5P47962 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl5P47962 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl5P47962 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl5P47962 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl5P47962 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl5P47962 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl5P47962 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl5P47962 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl5P47962 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl5P47962 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl5P47962 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl5P47962 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl5P47962 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl5P47962 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl5P47962 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl5P47962 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl5P47962 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl5P47962 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl5P47962 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl5P47962 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl5P47962 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl5P47962 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl5P47962 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl5P47962 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl5P47962 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl5P47962 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl5P47962 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl5P47962 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl5P47962 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl5P47962 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl5P47962 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl5P47962 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl5P47962 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl5P47962 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl5P47962 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl5P47962 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl5P47962 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl5P47962 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl5P47962 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl5P47962 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl5P47962 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl5P47962 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl5P47962 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl5P47962 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms