Protein–RNA interactions for Protein: P47878

Igfbp3, Insulin-like growth factor-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igfbp3P47878 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Igfbp3P47878 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Igfbp3P47878 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Igfbp3P47878 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Igfbp3P47878 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Igfbp3P47878 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Igfbp3P47878 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Igfbp3P47878 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Igfbp3P47878 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Igfbp3P47878 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Igfbp3P47878 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Igfbp3P47878 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Igfbp3P47878 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Igfbp3P47878 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Igfbp3P47878 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Igfbp3P47878 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Igfbp3P47878 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Igfbp3P47878 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Igfbp3P47878 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Igfbp3P47878 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Igfbp3P47878 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Igfbp3P47878 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Igfbp3P47878 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Igfbp3P47878 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Igfbp3P47878 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Igfbp3P47878 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Igfbp3P47878 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Igfbp3P47878 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Igfbp3P47878 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Igfbp3P47878 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Igfbp3P47878 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Igfbp3P47878 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Igfbp3P47878 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Igfbp3P47878 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Igfbp3P47878 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Igfbp3P47878 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Igfbp3P47878 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Igfbp3P47878 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Igfbp3P47878 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Igfbp3P47878 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Igfbp3P47878 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Igfbp3P47878 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Igfbp3P47878 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Igfbp3P47878 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Igfbp3P47878 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Igfbp3P47878 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Igfbp3P47878 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Igfbp3P47878 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Igfbp3P47878 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Igfbp3P47878 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Igfbp3P47878 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Igfbp3P47878 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Igfbp3P47878 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Igfbp3P47878 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Igfbp3P47878 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Igfbp3P47878 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Igfbp3P47878 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Igfbp3P47878 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Igfbp3P47878 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Igfbp3P47878 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Igfbp3P47878 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Igfbp3P47878 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Igfbp3P47878 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Igfbp3P47878 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Igfbp3P47878 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Igfbp3P47878 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Igfbp3P47878 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Igfbp3P47878 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Igfbp3P47878 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Igfbp3P47878 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Igfbp3P47878 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Igfbp3P47878 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Igfbp3P47878 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Igfbp3P47878 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Igfbp3P47878 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Igfbp3P47878 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Igfbp3P47878 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Igfbp3P47878 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Igfbp3P47878 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Igfbp3P47878 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Igfbp3P47878 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Igfbp3P47878 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Igfbp3P47878 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Igfbp3P47878 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Igfbp3P47878 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Igfbp3P47878 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Igfbp3P47878 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Igfbp3P47878 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Igfbp3P47878 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Igfbp3P47878 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Igfbp3P47878 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Igfbp3P47878 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Igfbp3P47878 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Igfbp3P47878 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Igfbp3P47878 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Igfbp3P47878 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Igfbp3P47878 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Igfbp3P47878 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Igfbp3P47878 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Igfbp3P47878 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms