Protein–RNA interactions for Protein: P46062

Sipa1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sipa1P46062 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sipa1P46062 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Sipa1P46062 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sipa1P46062 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sipa1P46062 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sipa1P46062 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sipa1P46062 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sipa1P46062 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sipa1P46062 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sipa1P46062 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sipa1P46062 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sipa1P46062 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sipa1P46062 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sipa1P46062 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sipa1P46062 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sipa1P46062 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sipa1P46062 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sipa1P46062 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sipa1P46062 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sipa1P46062 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sipa1P46062 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sipa1P46062 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sipa1P46062 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sipa1P46062 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sipa1P46062 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sipa1P46062 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sipa1P46062 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sipa1P46062 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sipa1P46062 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sipa1P46062 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sipa1P46062 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sipa1P46062 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sipa1P46062 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sipa1P46062 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sipa1P46062 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sipa1P46062 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sipa1P46062 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sipa1P46062 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sipa1P46062 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sipa1P46062 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sipa1P46062 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sipa1P46062 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sipa1P46062 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sipa1P46062 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sipa1P46062 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sipa1P46062 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sipa1P46062 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sipa1P46062 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sipa1P46062 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sipa1P46062 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sipa1P46062 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sipa1P46062 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sipa1P46062 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sipa1P46062 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sipa1P46062 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sipa1P46062 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sipa1P46062 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sipa1P46062 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sipa1P46062 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sipa1P46062 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sipa1P46062 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sipa1P46062 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sipa1P46062 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sipa1P46062 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sipa1P46062 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sipa1P46062 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sipa1P46062 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sipa1P46062 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sipa1P46062 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sipa1P46062 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sipa1P46062 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sipa1P46062 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sipa1P46062 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sipa1P46062 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sipa1P46062 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sipa1P46062 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sipa1P46062 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sipa1P46062 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sipa1P46062 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sipa1P46062 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sipa1P46062 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sipa1P46062 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sipa1P46062 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sipa1P46062 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sipa1P46062 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sipa1P46062 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sipa1P46062 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sipa1P46062 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sipa1P46062 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sipa1P46062 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sipa1P46062 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sipa1P46062 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sipa1P46062 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sipa1P46062 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sipa1P46062 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sipa1P46062 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sipa1P46062 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sipa1P46062 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sipa1P46062 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sipa1P46062 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms