Protein–RNA interactions for Protein: P43267

Sox15, Protein SOX-15, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox15P43267 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox15P43267 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox15P43267 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox15P43267 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox15P43267 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox15P43267 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox15P43267 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox15P43267 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox15P43267 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox15P43267 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox15P43267 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox15P43267 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox15P43267 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox15P43267 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox15P43267 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox15P43267 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox15P43267 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox15P43267 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox15P43267 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox15P43267 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox15P43267 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox15P43267 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox15P43267 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox15P43267 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox15P43267 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox15P43267 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox15P43267 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sox15P43267 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox15P43267 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox15P43267 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox15P43267 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox15P43267 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox15P43267 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox15P43267 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox15P43267 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox15P43267 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox15P43267 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox15P43267 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox15P43267 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox15P43267 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox15P43267 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox15P43267 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox15P43267 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox15P43267 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox15P43267 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox15P43267 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox15P43267 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox15P43267 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox15P43267 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox15P43267 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox15P43267 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox15P43267 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox15P43267 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox15P43267 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox15P43267 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox15P43267 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox15P43267 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox15P43267 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox15P43267 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox15P43267 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox15P43267 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox15P43267 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox15P43267 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox15P43267 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox15P43267 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox15P43267 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox15P43267 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox15P43267 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox15P43267 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox15P43267 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox15P43267 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox15P43267 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox15P43267 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox15P43267 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox15P43267 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox15P43267 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox15P43267 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox15P43267 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox15P43267 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox15P43267 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox15P43267 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox15P43267 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox15P43267 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox15P43267 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox15P43267 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox15P43267 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox15P43267 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox15P43267 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox15P43267 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox15P43267 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox15P43267 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox15P43267 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox15P43267 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox15P43267 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox15P43267 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox15P43267 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox15P43267 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox15P43267 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox15P43267 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox15P43267 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms