Protein–RNA interactions for Protein: P43247

Msh2, DNA mismatch repair protein Msh2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh2P43247 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Msh2P43247 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Msh2P43247 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msh2P43247 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msh2P43247 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msh2P43247 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msh2P43247 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msh2P43247 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msh2P43247 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msh2P43247 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msh2P43247 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msh2P43247 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msh2P43247 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msh2P43247 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msh2P43247 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msh2P43247 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msh2P43247 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msh2P43247 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msh2P43247 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msh2P43247 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msh2P43247 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msh2P43247 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msh2P43247 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Msh2P43247 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msh2P43247 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msh2P43247 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msh2P43247 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msh2P43247 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msh2P43247 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msh2P43247 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msh2P43247 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msh2P43247 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msh2P43247 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Msh2P43247 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msh2P43247 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msh2P43247 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msh2P43247 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msh2P43247 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msh2P43247 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Msh2P43247 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msh2P43247 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msh2P43247 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msh2P43247 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msh2P43247 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msh2P43247 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msh2P43247 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msh2P43247 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msh2P43247 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msh2P43247 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Msh2P43247 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Msh2P43247 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Msh2P43247 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Msh2P43247 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msh2P43247 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msh2P43247 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msh2P43247 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msh2P43247 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msh2P43247 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msh2P43247 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msh2P43247 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msh2P43247 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msh2P43247 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msh2P43247 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msh2P43247 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msh2P43247 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Msh2P43247 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Msh2P43247 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Msh2P43247 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Msh2P43247 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Msh2P43247 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Msh2P43247 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Msh2P43247 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Msh2P43247 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Msh2P43247 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Msh2P43247 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Msh2P43247 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Msh2P43247 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Msh2P43247 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Msh2P43247 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Msh2P43247 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Msh2P43247 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Msh2P43247 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Msh2P43247 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Msh2P43247 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Msh2P43247 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Msh2P43247 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Msh2P43247 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Msh2P43247 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Msh2P43247 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Msh2P43247 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Msh2P43247 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Msh2P43247 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Msh2P43247 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Msh2P43247 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Msh2P43247 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Msh2P43247 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Msh2P43247 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Msh2P43247 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Msh2P43247 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Msh2P43247 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms