Protein–RNA interactions for Protein: P42581

Hmx3, Homeobox protein HMX3, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmx3P42581 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmx3P42581 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmx3P42581 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmx3P42581 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmx3P42581 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmx3P42581 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmx3P42581 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmx3P42581 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmx3P42581 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmx3P42581 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmx3P42581 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmx3P42581 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmx3P42581 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmx3P42581 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmx3P42581 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmx3P42581 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmx3P42581 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmx3P42581 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmx3P42581 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmx3P42581 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmx3P42581 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmx3P42581 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmx3P42581 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmx3P42581 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmx3P42581 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmx3P42581 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmx3P42581 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmx3P42581 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmx3P42581 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmx3P42581 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmx3P42581 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmx3P42581 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmx3P42581 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmx3P42581 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmx3P42581 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmx3P42581 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmx3P42581 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmx3P42581 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmx3P42581 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmx3P42581 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmx3P42581 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmx3P42581 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmx3P42581 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmx3P42581 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmx3P42581 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmx3P42581 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmx3P42581 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmx3P42581 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmx3P42581 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmx3P42581 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmx3P42581 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmx3P42581 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmx3P42581 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmx3P42581 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmx3P42581 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmx3P42581 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmx3P42581 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmx3P42581 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmx3P42581 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmx3P42581 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmx3P42581 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmx3P42581 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmx3P42581 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmx3P42581 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmx3P42581 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmx3P42581 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmx3P42581 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms