Protein–RNA interactions for Protein: P42261

GRIA1, Glutamate receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA1P42261 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIA1P42261 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIA1P42261 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIA1P42261 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIA1P42261 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIA1P42261 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIA1P42261 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIA1P42261 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIA1P42261 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIA1P42261 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIA1P42261 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIA1P42261 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIA1P42261 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIA1P42261 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIA1P42261 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIA1P42261 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIA1P42261 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIA1P42261 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIA1P42261 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIA1P42261 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIA1P42261 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIA1P42261 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIA1P42261 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIA1P42261 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIA1P42261 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIA1P42261 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIA1P42261 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIA1P42261 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIA1P42261 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIA1P42261 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIA1P42261 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIA1P42261 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIA1P42261 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIA1P42261 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIA1P42261 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIA1P42261 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIA1P42261 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIA1P42261 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIA1P42261 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIA1P42261 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIA1P42261 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIA1P42261 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIA1P42261 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIA1P42261 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIA1P42261 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIA1P42261 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIA1P42261 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIA1P42261 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIA1P42261 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIA1P42261 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIA1P42261 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIA1P42261 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIA1P42261 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIA1P42261 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIA1P42261 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIA1P42261 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIA1P42261 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIA1P42261 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIA1P42261 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIA1P42261 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIA1P42261 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIA1P42261 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIA1P42261 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIA1P42261 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIA1P42261 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIA1P42261 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIA1P42261 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIA1P42261 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIA1P42261 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIA1P42261 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIA1P42261 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms