Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sept1P42209 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sept1P42209 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sept1P42209 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sept1P42209 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sept1P42209 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sept1P42209 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sept1P42209 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Sept1P42209 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sept1P42209 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sept1P42209 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sept1P42209 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sept1P42209 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sept1P42209 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sept1P42209 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sept1P42209 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sept1P42209 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sept1P42209 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sept1P42209 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sept1P42209 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sept1P42209 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Sept1P42209 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sept1P42209 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sept1P42209 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sept1P42209 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sept1P42209 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sept1P42209 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sept1P42209 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sept1P42209 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sept1P42209 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sept1P42209 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sept1P42209 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sept1P42209 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sept1P42209 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sept1P42209 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sept1P42209 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sept1P42209 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sept1P42209 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sept1P42209 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sept1P42209 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sept1P42209 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sept1P42209 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sept1P42209 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sept1P42209 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sept1P42209 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sept1P42209 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sept1P42209 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sept1P42209 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sept1P42209 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sept1P42209 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sept1P42209 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sept1P42209 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sept1P42209 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sept1P42209 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sept1P42209 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Sept1P42209 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sept1P42209 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sept1P42209 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Sept1P42209 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sept1P42209 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sept1P42209 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sept1P42209 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sept1P42209 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sept1P42209 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sept1P42209 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sept1P42209 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sept1P42209 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sept1P42209 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sept1P42209 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sept1P42209 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sept1P42209 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sept1P42209 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sept1P42209 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Sept1P42209 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sept1P42209 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sept1P42209 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sept1P42209 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sept1P42209 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sept1P42209 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sept1P42209 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sept1P42209 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sept1P42209 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sept1P42209 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sept1P42209 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sept1P42209 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sept1P42209 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sept1P42209 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sept1P42209 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sept1P42209 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sept1P42209 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sept1P42209 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sept1P42209 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sept1P42209 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sept1P42209 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Sept1P42209 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sept1P42209 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sept1P42209 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sept1P42209 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sept1P42209 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sept1P42209 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms