Protein–RNA interactions for Protein: P42208

Sept2, Septin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept2P42208 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sept2P42208 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sept2P42208 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sept2P42208 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sept2P42208 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sept2P42208 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sept2P42208 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sept2P42208 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sept2P42208 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sept2P42208 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Sept2P42208 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sept2P42208 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Sept2P42208 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sept2P42208 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sept2P42208 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sept2P42208 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sept2P42208 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sept2P42208 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sept2P42208 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sept2P42208 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sept2P42208 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sept2P42208 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sept2P42208 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Sept2P42208 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sept2P42208 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sept2P42208 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Sept2P42208 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sept2P42208 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sept2P42208 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Sept2P42208 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sept2P42208 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sept2P42208 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sept2P42208 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sept2P42208 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sept2P42208 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sept2P42208 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sept2P42208 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sept2P42208 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sept2P42208 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sept2P42208 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sept2P42208 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sept2P42208 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sept2P42208 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sept2P42208 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sept2P42208 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sept2P42208 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sept2P42208 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sept2P42208 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sept2P42208 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sept2P42208 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sept2P42208 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sept2P42208 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sept2P42208 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sept2P42208 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sept2P42208 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sept2P42208 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sept2P42208 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sept2P42208 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sept2P42208 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sept2P42208 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sept2P42208 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sept2P42208 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sept2P42208 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sept2P42208 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sept2P42208 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sept2P42208 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sept2P42208 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sept2P42208 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sept2P42208 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sept2P42208 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sept2P42208 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sept2P42208 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sept2P42208 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sept2P42208 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sept2P42208 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sept2P42208 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sept2P42208 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sept2P42208 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sept2P42208 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sept2P42208 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sept2P42208 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sept2P42208 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sept2P42208 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sept2P42208 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sept2P42208 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sept2P42208 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Sept2P42208 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Sept2P42208 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sept2P42208 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sept2P42208 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sept2P42208 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sept2P42208 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sept2P42208 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Sept2P42208 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sept2P42208 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sept2P42208 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sept2P42208 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sept2P42208 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sept2P42208 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sept2P42208 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms