Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tnfsf9P41274 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tnfsf9P41274 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tnfsf9P41274 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnfsf9P41274 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnfsf9P41274 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnfsf9P41274 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnfsf9P41274 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnfsf9P41274 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnfsf9P41274 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnfsf9P41274 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnfsf9P41274 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnfsf9P41274 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnfsf9P41274 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnfsf9P41274 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnfsf9P41274 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnfsf9P41274 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnfsf9P41274 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnfsf9P41274 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnfsf9P41274 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnfsf9P41274 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnfsf9P41274 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnfsf9P41274 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnfsf9P41274 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnfsf9P41274 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnfsf9P41274 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnfsf9P41274 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnfsf9P41274 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnfsf9P41274 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnfsf9P41274 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnfsf9P41274 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnfsf9P41274 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnfsf9P41274 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnfsf9P41274 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnfsf9P41274 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnfsf9P41274 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnfsf9P41274 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnfsf9P41274 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnfsf9P41274 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tnfsf9P41274 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tnfsf9P41274 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnfsf9P41274 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnfsf9P41274 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnfsf9P41274 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnfsf9P41274 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnfsf9P41274 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnfsf9P41274 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnfsf9P41274 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnfsf9P41274 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnfsf9P41274 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnfsf9P41274 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnfsf9P41274 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnfsf9P41274 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfsf9P41274 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfsf9P41274 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfsf9P41274 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfsf9P41274 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfsf9P41274 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfsf9P41274 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfsf9P41274 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfsf9P41274 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfsf9P41274 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfsf9P41274 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfsf9P41274 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfsf9P41274 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfsf9P41274 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfsf9P41274 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfsf9P41274 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfsf9P41274 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfsf9P41274 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfsf9P41274 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfsf9P41274 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfsf9P41274 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfsf9P41274 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfsf9P41274 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfsf9P41274 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfsf9P41274 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfsf9P41274 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfsf9P41274 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfsf9P41274 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfsf9P41274 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfsf9P41274 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfsf9P41274 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfsf9P41274 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfsf9P41274 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfsf9P41274 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfsf9P41274 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfsf9P41274 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfsf9P41274 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfsf9P41274 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfsf9P41274 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfsf9P41274 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfsf9P41274 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfsf9P41274 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfsf9P41274 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfsf9P41274 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfsf9P41274 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfsf9P41274 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfsf9P41274 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfsf9P41274 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms