Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
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LtbP41155 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LtbP41155 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LtbP41155 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LtbP41155 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LtbP41155 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LtbP41155 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LtbP41155 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LtbP41155 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LtbP41155 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LtbP41155 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LtbP41155 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LtbP41155 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LtbP41155 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LtbP41155 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LtbP41155 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LtbP41155 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LtbP41155 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LtbP41155 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LtbP41155 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LtbP41155 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LtbP41155 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LtbP41155 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LtbP41155 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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LtbP41155 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LtbP41155 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LtbP41155 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LtbP41155 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LtbP41155 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LtbP41155 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LtbP41155 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LtbP41155 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LtbP41155 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LtbP41155 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LtbP41155 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LtbP41155 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LtbP41155 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LtbP41155 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LtbP41155 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LtbP41155 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LtbP41155 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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LtbP41155 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LtbP41155 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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LtbP41155 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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LtbP41155 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LtbP41155 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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LtbP41155 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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LtbP41155 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LtbP41155 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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LtbP41155 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LtbP41155 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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LtbP41155 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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LtbP41155 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LtbP41155 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LtbP41155 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LtbP41155 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LtbP41155 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LtbP41155 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LtbP41155 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LtbP41155 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LtbP41155 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LtbP41155 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LtbP41155 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LtbP41155 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LtbP41155 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LtbP41155 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LtbP41155 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LtbP41155 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms