Protein–RNA interactions for Protein: P35436

Grin2a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2aP35436 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Grin2aP35436 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Grin2aP35436 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Grin2aP35436 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
Grin2aP35436 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Grin2aP35436 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Grin2aP35436 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Grin2aP35436 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Grin2aP35436 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Grin2aP35436 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Grin2aP35436 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Grin2aP35436 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Grin2aP35436 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Grin2aP35436 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Grin2aP35436 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Grin2aP35436 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Grin2aP35436 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Grin2aP35436 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Grin2aP35436 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Grin2aP35436 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Grin2aP35436 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Grin2aP35436 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Grin2aP35436 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
Grin2aP35436 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Grin2aP35436 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Grin2aP35436 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
Grin2aP35436 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Grin2aP35436 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Grin2aP35436 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Grin2aP35436 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
Grin2aP35436 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Grin2aP35436 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Grin2aP35436 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Grin2aP35436 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Grin2aP35436 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Grin2aP35436 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Grin2aP35436 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Grin2aP35436 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Grin2aP35436 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Grin2aP35436 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Grin2aP35436 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
Grin2aP35436 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Grin2aP35436 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Grin2aP35436 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
Grin2aP35436 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Grin2aP35436 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Grin2aP35436 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Grin2aP35436 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Grin2aP35436 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Grin2aP35436 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Grin2aP35436 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Grin2aP35436 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Grin2aP35436 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Grin2aP35436 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Grin2aP35436 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Grin2aP35436 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Grin2aP35436 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Grin2aP35436 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Grin2aP35436 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Grin2aP35436 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Grin2aP35436 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Grin2aP35436 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Grin2aP35436 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Grin2aP35436 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Grin2aP35436 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Grin2aP35436 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
Grin2aP35436 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Grin2aP35436 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Grin2aP35436 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Grin2aP35436 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Grin2aP35436 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Grin2aP35436 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Grin2aP35436 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Grin2aP35436 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Grin2aP35436 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Grin2aP35436 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Grin2aP35436 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Grin2aP35436 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Grin2aP35436 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Grin2aP35436 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Grin2aP35436 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Grin2aP35436 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Grin2aP35436 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Grin2aP35436 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
Grin2aP35436 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Grin2aP35436 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Grin2aP35436 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Grin2aP35436 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Grin2aP35436 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Grin2aP35436 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Grin2aP35436 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Grin2aP35436 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Grin2aP35436 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Grin2aP35436 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
Grin2aP35436 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Grin2aP35436 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Grin2aP35436 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Grin2aP35436 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Grin2aP35436 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Grin2aP35436 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms