Protein–RNA interactions for Protein: P35276

Rab3d, Ras-related protein Rab-3D, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3dP35276 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab3dP35276 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab3dP35276 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab3dP35276 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab3dP35276 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab3dP35276 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab3dP35276 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab3dP35276 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab3dP35276 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab3dP35276 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab3dP35276 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab3dP35276 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab3dP35276 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab3dP35276 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab3dP35276 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab3dP35276 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab3dP35276 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab3dP35276 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab3dP35276 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab3dP35276 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab3dP35276 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab3dP35276 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab3dP35276 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab3dP35276 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab3dP35276 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab3dP35276 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms