Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sftpa1P35242 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sftpa1P35242 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sftpa1P35242 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sftpa1P35242 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sftpa1P35242 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sftpa1P35242 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sftpa1P35242 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sftpa1P35242 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sftpa1P35242 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sftpa1P35242 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sftpa1P35242 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sftpa1P35242 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sftpa1P35242 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sftpa1P35242 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sftpa1P35242 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sftpa1P35242 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sftpa1P35242 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sftpa1P35242 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sftpa1P35242 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sftpa1P35242 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sftpa1P35242 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sftpa1P35242 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sftpa1P35242 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sftpa1P35242 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sftpa1P35242 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sftpa1P35242 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sftpa1P35242 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sftpa1P35242 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sftpa1P35242 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sftpa1P35242 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sftpa1P35242 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sftpa1P35242 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sftpa1P35242 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sftpa1P35242 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sftpa1P35242 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sftpa1P35242 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sftpa1P35242 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sftpa1P35242 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sftpa1P35242 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sftpa1P35242 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sftpa1P35242 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sftpa1P35242 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sftpa1P35242 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sftpa1P35242 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sftpa1P35242 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sftpa1P35242 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sftpa1P35242 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sftpa1P35242 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sftpa1P35242 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sftpa1P35242 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sftpa1P35242 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sftpa1P35242 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sftpa1P35242 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sftpa1P35242 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sftpa1P35242 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sftpa1P35242 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sftpa1P35242 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sftpa1P35242 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sftpa1P35242 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sftpa1P35242 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sftpa1P35242 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sftpa1P35242 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sftpa1P35242 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sftpa1P35242 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sftpa1P35242 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sftpa1P35242 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sftpa1P35242 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sftpa1P35242 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sftpa1P35242 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sftpa1P35242 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sftpa1P35242 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sftpa1P35242 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sftpa1P35242 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sftpa1P35242 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sftpa1P35242 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sftpa1P35242 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sftpa1P35242 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sftpa1P35242 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sftpa1P35242 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sftpa1P35242 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sftpa1P35242 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sftpa1P35242 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sftpa1P35242 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sftpa1P35242 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sftpa1P35242 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sftpa1P35242 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sftpa1P35242 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sftpa1P35242 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sftpa1P35242 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sftpa1P35242 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sftpa1P35242 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sftpa1P35242 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sftpa1P35242 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sftpa1P35242 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sftpa1P35242 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sftpa1P35242 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sftpa1P35242 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sftpa1P35242 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sftpa1P35242 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms