Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apoc3P33622 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apoc3P33622 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apoc3P33622 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apoc3P33622 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apoc3P33622 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apoc3P33622 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoc3P33622 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms