Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxc11P31313 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxc11P31313 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxc11P31313 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxc11P31313 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxc11P31313 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxc11P31313 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxc11P31313 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxc11P31313 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxc11P31313 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxc11P31313 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxc11P31313 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxc11P31313 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxc11P31313 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxc11P31313 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxc11P31313 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxc11P31313 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxc11P31313 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxc11P31313 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxc11P31313 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxc11P31313 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxc11P31313 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxc11P31313 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxc11P31313 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxc11P31313 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxc11P31313 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxc11P31313 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxc11P31313 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxc11P31313 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxc11P31313 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxc11P31313 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxc11P31313 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxc11P31313 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxc11P31313 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxc11P31313 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxc11P31313 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxc11P31313 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxc11P31313 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxc11P31313 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxc11P31313 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxc11P31313 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxc11P31313 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxc11P31313 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxc11P31313 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxc11P31313 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxc11P31313 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxc11P31313 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxc11P31313 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxc11P31313 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxc11P31313 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxc11P31313 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxc11P31313 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxc11P31313 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxc11P31313 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxc11P31313 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxc11P31313 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxc11P31313 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxc11P31313 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxc11P31313 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxc11P31313 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxc11P31313 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxc11P31313 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxc11P31313 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxc11P31313 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxc11P31313 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxc11P31313 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxc11P31313 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxc11P31313 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Hoxc11P31313 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Hoxc11P31313 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Hoxc11P31313 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxc11P31313 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxc11P31313 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxc11P31313 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxc11P31313 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxc11P31313 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxc11P31313 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxc11P31313 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxc11P31313 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxc11P31313 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxc11P31313 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxc11P31313 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxc11P31313 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxc11P31313 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxc11P31313 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxc11P31313 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms