Protein–RNA interactions for Protein: P30658

Cbx2, Chromobox protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx2P30658 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cbx2P30658 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cbx2P30658 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cbx2P30658 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cbx2P30658 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cbx2P30658 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cbx2P30658 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cbx2P30658 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cbx2P30658 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cbx2P30658 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cbx2P30658 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cbx2P30658 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cbx2P30658 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cbx2P30658 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cbx2P30658 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cbx2P30658 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cbx2P30658 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cbx2P30658 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cbx2P30658 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cbx2P30658 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cbx2P30658 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cbx2P30658 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cbx2P30658 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cbx2P30658 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cbx2P30658 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cbx2P30658 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cbx2P30658 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cbx2P30658 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cbx2P30658 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cbx2P30658 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cbx2P30658 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cbx2P30658 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cbx2P30658 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cbx2P30658 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cbx2P30658 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cbx2P30658 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cbx2P30658 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cbx2P30658 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cbx2P30658 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cbx2P30658 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cbx2P30658 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cbx2P30658 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cbx2P30658 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cbx2P30658 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cbx2P30658 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cbx2P30658 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cbx2P30658 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cbx2P30658 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cbx2P30658 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cbx2P30658 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cbx2P30658 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cbx2P30658 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cbx2P30658 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cbx2P30658 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cbx2P30658 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cbx2P30658 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cbx2P30658 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cbx2P30658 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cbx2P30658 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cbx2P30658 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cbx2P30658 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cbx2P30658 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cbx2P30658 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cbx2P30658 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cbx2P30658 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cbx2P30658 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cbx2P30658 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cbx2P30658 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cbx2P30658 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cbx2P30658 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cbx2P30658 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cbx2P30658 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cbx2P30658 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cbx2P30658 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cbx2P30658 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cbx2P30658 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cbx2P30658 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cbx2P30658 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cbx2P30658 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cbx2P30658 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cbx2P30658 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cbx2P30658 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cbx2P30658 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cbx2P30658 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cbx2P30658 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cbx2P30658 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cbx2P30658 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cbx2P30658 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cbx2P30658 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cbx2P30658 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cbx2P30658 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cbx2P30658 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cbx2P30658 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cbx2P30658 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cbx2P30658 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cbx2P30658 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cbx2P30658 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cbx2P30658 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cbx2P30658 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cbx2P30658 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms