Protein–RNA interactions for Protein: P28322

Etv4, ETS translocation variant 4, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv4P28322 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Etv4P28322 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Etv4P28322 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Etv4P28322 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Etv4P28322 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Etv4P28322 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Etv4P28322 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Etv4P28322 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Etv4P28322 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Etv4P28322 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Etv4P28322 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Etv4P28322 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Etv4P28322 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Etv4P28322 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Etv4P28322 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Etv4P28322 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Etv4P28322 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Etv4P28322 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Etv4P28322 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Etv4P28322 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Etv4P28322 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Etv4P28322 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Etv4P28322 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Etv4P28322 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Etv4P28322 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Etv4P28322 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Etv4P28322 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Etv4P28322 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Etv4P28322 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Etv4P28322 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Etv4P28322 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Etv4P28322 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Etv4P28322 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Etv4P28322 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Etv4P28322 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Etv4P28322 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Etv4P28322 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Etv4P28322 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Etv4P28322 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Etv4P28322 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Etv4P28322 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Etv4P28322 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Etv4P28322 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Etv4P28322 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Etv4P28322 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Etv4P28322 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Etv4P28322 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Etv4P28322 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Etv4P28322 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Etv4P28322 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Etv4P28322 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Etv4P28322 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Etv4P28322 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Etv4P28322 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Etv4P28322 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Etv4P28322 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Etv4P28322 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Etv4P28322 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Etv4P28322 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Etv4P28322 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Etv4P28322 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Etv4P28322 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Etv4P28322 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Etv4P28322 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Etv4P28322 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Etv4P28322 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Etv4P28322 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Etv4P28322 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Etv4P28322 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Etv4P28322 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Etv4P28322 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Etv4P28322 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Etv4P28322 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Etv4P28322 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Etv4P28322 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Etv4P28322 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Etv4P28322 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Etv4P28322 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Etv4P28322 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Etv4P28322 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Etv4P28322 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Etv4P28322 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Etv4P28322 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Etv4P28322 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Etv4P28322 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Etv4P28322 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Etv4P28322 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Etv4P28322 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Etv4P28322 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Etv4P28322 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Etv4P28322 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Etv4P28322 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Etv4P28322 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Etv4P28322 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Etv4P28322 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Etv4P28322 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Etv4P28322 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Etv4P28322 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Etv4P28322 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Etv4P28322 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms